Profil

  • Professeur titulaire, Département de Biologie Moléculaire, Biochimie Médicale et Pathologie Université Laval
  • Chaire de Recherche du Canada en Biologie de la Chromatine et Epigénétique Moléculaire
  • Directeur, Axe oncologie, Centre de Recherche du CHU de Québec-Université Laval
  • Groupe St-Patrick de Recherche en Oncologie Fondamentale
  • Chercheur, Centre de Recherche sur le Cancer de l'Université Laval

Formations et expériences professionnelles

  • Postdoctorat en Biologie Moléculaire et Biochimie, Center for Gene Regulation, The Pennsylvania State University, State College PA (Jerry L. Workman’s lab)
  • Doctorat (PhD) en Biologie Cellulaire et Moléculaire, Université Laval (labo Adolfo Ruiz-Carrillo)

Intérêts de recherche

  • Structure et fonction de la chromatine
  • Complexes protéiques modifiant la chromatine
  • Epigénétique moléculaire
  • Régulation des gènes
  • Réparation des dommages sur l’ADN

Impact de la recherche

Les activités de notre équipe visent la compréhension des mécanismes épigénétiques qui contrôlent l’expression et la stabilité du génome. Ces mécanismes sont au cœur du phénomène qui explique que des cellules de différents tissus dans le corps humain aient des rôles et caractéristiques propres tout en possédant le même bagage génétique.  Par le fait même, les acteurs dans ces mécanismes sont impliqués dans toutes les formes de cancer et d’autres pathologies.

Pour nous suivre

Pour nous joindre

  • 9, rue McMahon
  • Québec
  • Québec , Canada
  • G1R 3S3

Projets

Thématique

CHAMPS D'INTÉRÊTS

Il est désormais évident que la reconfiguration de la structure des chromosomes est une étape cruciale dans les processus contrôlant l'expression et la stabilité du génome humain, et conséquemment la différenciation/prolifération cellulaire et leur dérégulation menant aux maladies comme le cancer. Les activités impliquées dans cette reconfiguration incluent des complexes multiprotéiques qui modifient l’unité de base des chromosomes, i.e. le nucléosome, où l'ADN est enroulé autour d'un noyau protéique.

La régulation transcriptionnelle des gènes est un processus fondamental de la vie cellulaire. C'est par l'expression de protéines à des moments clés durant le cycle cellulaire et la différenciation tissulaire qu'une cellule peut croître, se diviser et accomplir sa tâche spécifique en réponse à différents signaux. Lorsqu'il y a dérégulation de ce processus, il en résulte des défauts de fonctionnement dans la cellule, pouvant entraîner sa prolifération anarchique (cancer) ou sa mort. Une grande partie de ce contrôle est liée à la configuration dynamique de l'empaquetage du matériel génétique de la cellule: la chromatine. Les recherches du laboratoire portent sur le rôle et les mécanismes d'action de complexes protéiques modifiant la structure de la chromatine dans la régulation transcriptionnelle.

Un autre évènement pouvant mener à la perturbation de la fonction cellulaire est l'instabilité de son génome. En effet, l'accumulation de bris survenant à des endroits critiques dans l'ADN peut avoir de lourdes conséquences comme la formation de cellules cancéreuses. Pour contrer ce phénomène, la cellule dispose de plusieurs mécanismes de réparation nécessitant tous l'accès au dommage sur l'ADN. C'est pour cette raison que l'étude du rôle des complexes de reconfiguration chromatinienne dans les voies de réparation s'avère essentielle.

Utilisant des techniques de biologie, biochimie et génétique moléculaire, en parallèle avec la protéomique et génomique fonctionnelle, notre recherche fournira d’importantes informations sur les événements fondamentaux contrôlant l'expression et le maintien du bagage génétique, ainsi que la prolifération cellulaire. L'information que l'on acquiert pourra être utilisé dans l'élaboration de médicaments/outils diagnostiques, ciblant ces activités moléculaires, dans la lutte contre le cancer, autant au niveau préventif que du traitement de la maladie elle-même.

Projet 1 - Modifications de la chromatine durant la transcription, la réplication et la réparation de l’ADN; le rôle de complexes acétyltransférases suppresseurs de tumeurs et leurs partenaires fonctionnels

Les suppresseurs de tumeur de la famille ING sont hautement conservés à travers les eucaryotes et chaque membre de cette famille fait partie d’un complexe protéique modulant les niveaux d’acétylation de la chromatine. Certains sont recrutés à des gènes pour réguler leur expression, d’autres apparaissent aux sites de dommage sur l’ADN pour faciliter la réparation ou suivent la polymérase pour permettre la duplication du bagage génétique.

Les projets de recherche du laboratoire utilisent le système modèle puissant de la levure ainsi que des cellules humaines en culture afin de caractériser les rôles et les mécanismes d’action des ces complexes protéiques dans les fonctions nucléaires chez les cellules eucaryotes.

1) Régulation et impact du complexe histone acetyltransferase NuA4/Tip60 dans la régulation transcriptionnelle et la réparation des cassures double-brins sur l’ADN.

a-Caractérisation structurale et fonctionnelle du complexe et de ses différentes sous-unités.

b-Mécanismes de recrutement aux promoteurs et sites de dommages sur l’ADN.

c-relation fonctionnelle avec l’incorporation de variants d’histones dans la chromatine.

2) Caractérisation structurale et fonctionnelle des autres complexes acétyltransférases contenant un suppresseur de tumeur ING dasn l’expression et le maintien du génome.

3) Rôle des modifications d’histones dans l’établissement des frontières euchromatine-hétérochromatine.

4) Mécanismes oncogéniques de translocations chromosomiques liant physiquement des complexes acétyltransferases avec des protéines de la famille Polycomb.

Autres activités de recherche

The NuA4 histone acetyltransferase complex



The ING family of tumor suppressors and their associated complexes controlling acetylation


Genome-wide location analysis (ChIP-seq) of histone modifications and regulators



Équipe

Laboratory of Chromatin Biology and Molecular Epigenetics

Professionnel(le)s de recherche

Valérie Côté,  B.Sc. valerie.cote@crhdq.ulaval.ca Projets :
  • The Lab Manager, projects with Saccharomyces cerevisiae
Rhea T. Utley,  Ph.D. rhea.utley@crhdq.ulaval.ca Projets :
  • Academic/research support
Catherine Lachance,  Ph.D. catherine.lachance@crchudequebec.ulaval.ca Projets :
  • Projects with mammalian cells

Étudiant(e)s gradué(e)s

Maeva Devoucoux,  M.Sc. devoucoux.m@gmail.com Projets :
  • TINTIN in human cells vs Txn elongation
Salar Ahmad,  M.Sc. salarahmad001@gmail.com Projets :
  • NuA4 vs Rad9 in repair pathway selection
Xue (Anna) Cheng,  M.Sc. xue.cheng.1@ulaval.ca Projets :
  • NuA4 function during DSB repair
Jonathan Humbert,  M.Sc. jonathanhumbertjh@gmail.com Projets :
  • DMAP1 link to genome stability
Deepthi Sudarshan,  M.Sc. deepthisudarshan@gmail.com Projets :
  • Oncogenic fusions between NuA4 and polycomb
Alexandre Prudente,  M.Sc. prudente.alexandre@yahoo.fr Projets :
  • MRG proteins in genome stability

Vie du laboratoire

Alumni

  • -18 ex-graduate students: Karine Jacquet Ph.D. (FRQNT student), Pierre Billon Ph.D., Pauline Herst M.Sc., Marie-Eve Lalonde Ph.D. (NSERC/FRQS student, Dean’s Honor list), Dorine Rossetto Ph.D., Mohd Altaf Bhat Ph.D., Julie Monnet-Saksouk M.Sc., Myriam Cramet M.Sc., Yannick Doyon Ph.D. (CIHR/CGS student, Dean’s Honor list), Andréanne Auger Ph.D. (NSERC/FRSQ student, Dean’s Honor list), Nicolas Lacoste Ph.D. (Canada Foreign Affairs student), Olivier-Jobin Robitaille M.Sc. (CIHR/CGS student, Dean’s Honor list), Alexandre Boudreault M.Sc. (NSERC student, Dean's Honor list), Nathalie Bouchard M.Sc. (NSERC student, Dean’s Honor list), Julie Savard M.Sc. (FCAR student), Israel Fortin M.Sc. (NSERC/CGS student), Dominique Cronier M.Sc., Anne-Julie Landry M.Sc.
  • -11 ex-post-docs: Mathieu Dalvai, Wajid Bhat, Anne-Lise Steunou,, Romain Gioia, Nikita Avvakumov (CIHR/IA fellow), Vasileia Sapountzi (CIHR fellow), Nehmé Saksouk, Christelle Cayrou, Marcela Covic, Amine Nourani (CIHR fellow), Luc Galarneau.
  • -4 ex-research assistants: Céline Roques Ph.D., Stéphane Allard M.Sc., Patricia Savard, M.Sc., Sandra Piquet M.Sc.

Publications

Pubmed

Autres

    Voir le Lien Pubmed

    A.-L Steunou, D. Rossetto and J. Côté (2014) "Regulating chromatin by histone acetylation". Fundamentals of Chromatin, edited by J.L. Workman for Springer. Chapter 4; p. 147-212.

Subventions

Autres subventions

  • Canadian Institutes of Health Research | Foundation Scheme Research Program Grant | "Control of Genome Expression and Maintenance by MYST-ING Tumor Suppressor Complexes", 2015-2022.
  • Canada Research Chairs | Research Chair, Tier I | "Canada Research Chair in Chromatin Biology and Molecular Epigenetics", 2008-2021.
  • Quebec Breast Cancer Foundation/Cancer Research Society | Operating Grant | "Acetylation of the breast cancer suppressors BRCA1, BRCA2 and PALB2: from functional insights to an anti-cancer approach", co-PI Jean-Yves Masson, 2015-2019.